fast.genomicscompare 6,575 genera of bacteria & archaea

 

XYC2-FULL-35-21 sp004322215 FW215_bin.12

Genome identifier: GCA_004322215.1

NCBI assembly name: ASM432221v1

GTDB taxonomy: Bacteria, Bacteroidota, Kapaibacteriia, Kapaibacteriales, UBA2268, XYC2-FULL-35-21, XYC2-FULL-35-21 sp004322215

NCBI taxonomy: Bacteria, Bacteroidota

Scaffolds: 47

Genes: 3,442 Protein-coding: 3,356 RNAs: 52 pseudogenes: 34

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BLAST

Search annotations:

Curated BLAST:

Examples: perchlorate or 1.2.1.88

GapMind for amino acid biosynthesis or carbon catabolism (takes 10-40 seconds)

Scaffolds

scaffoldId description length
SCSM01000001.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-5529, whole genome shotgun sequence 124,987
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SCSM01000008.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-22723, whole genome shotgun sequence 12,657
SCSM01000009.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-24192, whole genome shotgun sequence 7,752
SCSM01000010.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-26033, whole genome shotgun sequence 80,865
SCSM01000011.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-27882, whole genome shotgun sequence 643,366
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SCSM01000013.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-34622, whole genome shotgun sequence 188,684
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SCSM01000015.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-39821, whole genome shotgun sequence 87,686
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SCSM01000019.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-44816, whole genome shotgun sequence 2,497
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SCSM01000021.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-47237, whole genome shotgun sequence 175,842
SCSM01000022.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-52808, whole genome shotgun sequence 24,499
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SCSM01000024.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-56378, whole genome shotgun sequence 106,728
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SCSM01000031.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-74799, whole genome shotgun sequence 31,374
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SCSM01000041.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-119848, whole genome shotgun sequence 3,051
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SCSM01000043.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-129546, whole genome shotgun sequence 2,604
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SCSM01000047.1 MAG: Bacteroidetes bacterium isolate FW215_bin.12 FW215_bin.12-14984, whole genome shotgun sequence 1,235

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory